Alle dem Museum zur Verfügung gestellten Räume sind Bestandteil der Kathedrale der Stadt Badajoz, Extremadura, und liegen im Klostergang. Es handelt sich um ein kirchliches Gut mit religiöser Architektur. Die Kunst und Werke haben unterschiedlichen Wert in der religiösen Malerei, Nennenswert sind Werke wie die Monstranzen, vor allem die für die Kirchumgänge bestimmte, turmartige Monstranz, die Elfenbeinfiguren und alte Möbel im neuen Kapitelsaal.

Das Museum bewahrt interessante Sehenswürdigkeiten und Gemälde aus der Zeit vom 17. Jahrhundert bis 19. Jahrhundert. Nennenswert ist der Lobspruch auf dem Grab von Lorenzo Suárez de Figueroa, eines der ersten Kunstwerke der Renaissance, die aus Italien gebracht wurden. Das Werk wird dem venezianischen Bildhauer Alexandro Leopardi zugeschrieben.

In jeder Ecke gibt es einen Altar mit mehreren großen Gemälden. Drei dieser Werke der Kunst sind von José de Mures, Maler des Barock, der aus der Stadt Sevilla stammte aber in der Stadt Badajoz ansässig war. Auch eine Figur von Johannis dem Täufer, vom polnischen Maler Antonio Lucenqui. Andere Werke schuf der in der Extremadura unbekannte Maler Guerrero und Antonio Moreal, der in der Stadt Zafra lebte. In dem alten Kapitelsaal können wir uns vortreffliche hölzerne Reliefs anschauen, kleine Kupferstiche, die Figur von Johannis dem Täufer, zwei Gemälde von Blas de Cervera aus dem 17. Jahrhundert und noch ein Mures zugeschriebenes Bild der Jungfrau.
Im Nebensaal befinden sich zwei Kruzifixe aus Elfenbein und eine herrliche Mostranz für Prozessionen in der Extremadura. Im Halbsouterrain treten eine Frontale aus dem 19. Jahrhundert und ein Relief der Jungfrau mit dem Kind auf Marmorstein hervor. Die Hauptwerke sind ein kleiner Altaraufsatz mit einem Relief der Jungfrau, auch mit dem Kind, auf Alabaster, dem Florentiner Settignano zugeschrieben und eine kupferne Geißelungsdarstellung. Meisterhaft sind auch drei silberne Monstranzen, mehrere Ölgemälde von Palomino und Pedro Atanasio de Bocanegra und fünf kleine Gemälde von Morales.

Der neue Kapitelsaal bewahrt Werke aus verschiedenen Epochen der Extremadura und unterschiedlicher Thematik: Kunstwerke der Familie Mures, Nachbildungen von Werken italienischer Meister und Bildnisse von Prälaten aus der Stadt Badajoz.

Die wichtigsten Werke hier sind zwei Elfenbeinfiguren und vier Glasschränke, die Chorbücher mit Miniaturarbeiten aus dem 16. Jahrhundert aufbewahren.

Das Kathedralmuseum der Stadt Badajoz befindet sich in einem Kreuzgang und in vier Nebenräumen des Doms. Der erste ist der “alte Kapitelsaal” und von hier gelangen wir in einen kleineren Saal. Von diesem zweiten Saal gehen wir in den Halbsouterrain und dann nach unten in einen anderen Saal und von diesem in den “neuen Kapitelsaal”. In der Nähe befindet sich die Sakristei mit einer herrlichen Sammlung flämischer Wandteppiche aus dem 16. Jahrhundert der Extremadura.

Der Kreuzgang ist ein Muster gotischer Architektur in der Extremadura mit portugiesischen Einflüssen; sehenswert sind die Gewölbe und eine originelle Balustrade mit Säulen. Der Klostergang wurde zu Beginn im 16. Jahrhundert, zwischen 1500 und 1520, unter dem Pontifikat von Alonso Manrique de Lara erbaut.